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近年来，单细胞技术已广泛地应用于基础科研和临床研究等方面。为了帮助大家更好地了解单细胞行业的最新资讯，我们通过PubMed数据库检索，整理出了7月份单细胞技术应用于各种研究的文章共有篇（包括article、letter、review），其中IF（影响因子）大于9分的文章有篇（文章后面使用表格列出），现选择其中28篇代表性文章进行导读。详情如下：

1

英文题目：HumanCNSbarrier-formingorganoidswithcerebrospinalfluidproduction

中文题目：可分泌脑脊液的人中枢神经系统屏障类器官

发表时间：-07-10

发表杂志：Science(NewYork,N.Y.)

影响因子：41.

DOI：10./science.aaz

摘要：脑脊液（CSF）是一种重要的液体，它提供营养物质和信号分子，并清除大脑中的有毒副产品。脑脊液是由脉络丛（ChP）产生的，脉络丛是一种保护性上皮屏障，可防止有毒分子或药物从血液中自由进入。研究人员建立了具有选择性屏障的人类ChP类器官，并能在独立环境中分泌类似脑脊液的液体。研究证明，这种体外屏障对小分子的选择性与体内的ChP相同，ChP-CSF类器官可用于预测新化合物在中枢神经系统（CNS）的通透性。ChP-CSF类器官的转录组学和蛋白质组学特征与体内ChP高度相似。最后，用单细胞转录组学和蛋白质组学分析的交叉结合，揭示了人类脑脊液中，先前未被确认的特殊上皮亚型产生的关键成分。

2

英文题目：Cancercellsdeploylipocalin-2tocollectlimitingironinleptomeningealmetastasis

中文题目：癌细胞在软脑膜转移中利用Lipocalin-2收集限制性铁

发表时间：-07-17

发表杂志：Science

影响因子：41.

DOI：10./science.aaz

摘要：肿瘤微环境在肿瘤进展中起着关键的调节作用，特别是在中枢神经系统转移中。充满脑脊液(CSF)的软膜中的癌细胞面临着巨大的微环境挑战，包括炎症和稀少的微量营养素。为了研究这些软脑膜转移瘤(LM)中的癌细胞克服这些限制的机制，我们对5名LM患者的CSF进行了单细胞RNA测序。我们发现，脑脊液中的癌细胞，而不是巨噬细胞，表达铁结合蛋白Lipocalin-2(Lcn2)及其受体SCL22A17。这些巨噬细胞产生炎性细胞因子，诱导癌细胞Lcn2表达，但本身不产生Lcn2。在LM小鼠模型中，Lcn2/SLC22A17系统支持癌细胞生长，铁螯合疗法则抑制癌细胞生长。因此，癌细胞似乎通过竞争巨噬细胞的铁而在脑脊液中存活。

3

英文题目：Asingle-celltranscriptomicatlascharacterizesageingtissuesinthemouse

中文题目：小鼠衰老组织的单细胞转录组图谱

发表时间：-7-15

发表杂志：Nature

影响因子：42.

DOI:10./s---1

摘要：衰老的特点是生理完整性逐渐丧失，导致功能受损，更容易死亡。尽管近年来取得了迅速的进展，但许多导致健康生理逐渐丧失的分子和细胞过程却鲜为人知。为了更好地了解这些过程，我们在这里生成了一个横跨Musmusculus寿命的单细胞转录图谱，其中包括来自23个组织和器官的数据。我们发现细胞特异性的变化发生在多种细胞类型和器官之间，以及不同器官的细胞组成中与年龄有关的变化。利用单细胞转录数据，我们评估了衰老等不同老化标志的细胞类型特异性表现，基因组不稳定性和免疫系统的变化。这个转录图谱--我们称之为TabulaMurisSenis，或“小鼠衰老细胞图谱”--提供了关于衰老最重要的特征，是如何反映在广泛的组织和细胞类型中的分子信息。

4

英文题目：Single-celllineagetracingunveilsaroleforTCF15inhaematopoiesis

中文题目：单细胞谱系溯源揭示了TCF15在造血中的作用

发表时间：-7-15

发表杂志：Nature

影响因子：42.

DOI:10./s---6

摘要：骨髓移植治疗依赖于造血干细胞(HSCs)的终身再生能力。HSCs在克隆水平上呈现出多种复杂的再生行为，但这种多样性背后的机制仍不能确定。单细胞RNA测序的最新进展揭示了HSCs之间的转录差异，为其功能异质性提供了可能的解释。然而，测序分析的破坏性的本质阻碍了同时观察干细胞的状态和功能。为了解决这一难题，我们采用了可表达的慢病毒标签技术，能够同时分析单个成年造血干细胞的细胞系和转录组，以及它们在长期骨髓重建过程中的克隆轨迹。对具有不同行为的克隆间基因表达差异的分析揭示了一种固有的分子特征，它是造血干细胞长期功能性再生的特征。通过体内CRISPR筛选，我们发现转录因子TCF15是驱动HSC静止和长期自我更新所必需和足够的。在原位中，Tcf15的表达标记了真正的多能造血干细胞最原始的一个亚群。总之，我们的工作阐明了与功能干细胞异质性相关的克隆内在分子程序，并确定了维持造血干细胞自我更新状态的机制。

5

英文题目：Mechanismsofstretch-mediatedskinexpansionatsingle-cellresolution

中文题目：单细胞分辨率下拉伸介导的皮肤扩张机制

发表时间：-07-29

发表杂志：Nature

影响因子：42.

DOI：10./s---7

摘要：皮肤对拉伸反应生长的能力在重建手术中得到了利用。虽然在体外研究了表皮细胞对拉伸的反应，但机械力如何影响其在体内的行为仍不清楚。在这里我们开发了一个小鼠模型，在这个模型中，拉伸对皮肤表皮的影响可以在单细胞分辨率下进行研究。利用一种结合了克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法，我们发现拉伸通过在表皮干细胞的更新活动中产生暂时的偏差来诱导皮肤扩张，而第二个基底祖细胞亚群仍然致力于分化。转录和染色质分析确定细胞状态和基因调控网络是如何通过拉伸来调节的。利用药物抑制剂和小鼠突变体，我们确定了在体内以单细胞分辨率控制拉伸介导的组织扩张的逐步机制

6

英文题目：Single-CellRNASequencingtoDissecttheImmunologicalNetworkofAutoimmuneMyocarditis

中文题目：单细胞RNA测序分析自身免疫性心肌炎的免疫网络

发表时间：-07-28

发表杂志：Circulation

影响因子：23.

DOI：10./CIRCULATIONAHA..

摘要：

背景：心肌炎可发展为扩张型心肌病(DCM)，此疾病可能需要心脏移植(HTx)。心肌炎分期的免疫网络尚不清楚。本研究旨在研究心肌炎向心肌病转变过程中的免疫网络，并找出引起心肌炎炎症反应的基因。

方法：用肌球蛋白重链α肽治疗小鼠，建立实验性自身免疫性心肌炎(EAM)模型。我们对从小鼠心脏中提取的CD45+细胞进行了单细胞RNA测序分析，这些细胞在不同的EAM阶段，包括正常对照组、急性炎症、亚急性炎症和肌病阶段。人体心脏组织是从接受心脏移植的患者通过手术取出的心脏中收集的。

结果：在个细胞中，共鉴定出26个细胞亚型。在所有疾病阶段，巨噬细胞都是主要的免疫细胞群(60%)，并且发现了一个炎症相关的巨噬细胞簇，在该簇中HIF1a调节基因的表达上调。EAM诱导后，中性粒细胞数量增加，中性粒细胞释放IL-1参与EAM过程。亚急性炎症期T细胞所占比例最高。急性炎症期以上调HIF1a调节基因表达的辅助性T细胞为主，亚急性炎症期以调节性T细胞为主，肌病期以释放IL-17的γδT细胞为主。此外，HIF1a的表达水平与炎症程度相关。另外，PX-可减轻EAM不同时相的炎症反应。最后，HIF1a在急性自身免疫性心肌炎患者中的表达水平高于扩张型心肌病患者和健康对照组。

结论：我们在这里展示了心脏免疫细胞在EAM不同阶段的综合单细胞图谱。此外，我们还通过调节免疫细胞活性，特别是巨噬细胞簇2和T辅助细胞17，阐明了HIF1a在炎症反应中的作用。还有，HIF1a抑制剂可减轻EAM模型的炎性细胞浸润，可能成为临床上潜在的治疗靶点。

7

英文题目：MicrogliaRequireCD4TCellstoCompletetheFetal-to-AdultTransition

中文题目：小胶质细胞需要CD4T细胞辅助完成其由“胎儿到成人”的发育状态转换

发表时间：-7-22

发表杂志：Cell

影响因子：38.

DOI：10./j.cell..06.

摘要：大脑通常被认为是一个免疫豁免器官。尽管，已有报道表明CD4T细胞存在于中枢神经系统中，但是，其是否存在于大脑中仍具有争议，其功能在很大程度上尚不清楚。我们联合采用了显微镜成像技术、单细胞测序技术及手术处理等方法发现在小鼠和人的大脑中都存在CD69+CD4T细胞群，该群体不同于循环CD4T细胞。驻留在大脑中的细胞群是通过活化的循环细胞从原位分化而来的，并由自身抗原和外周微生物共同作用而形成。单细胞测序的结果表明，CD4T胞缺失，小鼠大脑中的常驻免疫细胞--小胶质细胞---仍然停留在胎儿和成人发育状态之间，发育发生异常。小胶质细胞的成熟缺陷导致过量神经元突触形成，从而引发大脑行为异常。这些结果阐明了CD4T细胞在大脑发育中的作用，并且提供了神经系统和免疫系统协同发育的潜在动力。

8

英文题目：Asingle-cellatlasoftheperipheralimmuneresponseinpatientswithsevereCOVID-19

中文题目：重症COVID-19患者外周免疫反应的单细胞图谱

发表时间：-07

发表杂志：NatureMedicine

影响因子：36.

DOI：10./s---y

摘要：我们迫切需要更好地了解年冠状病毒病（COVID-19）的病理生理学，这是由SARS-CoV-2引起的全球大流行，已在全球范围内感染了多万人。约20%的COVID-19患者会发展成严重疾病，5%的患者需要重症监护。严重的疾病与外周免疫活动的改变有关，包括炎症性单核细胞亚群产生的促炎性细胞因子水平升高、淋巴细胞减少和T细胞衰竭。为了阐明外周免疫细胞中可能导致严重COVID-19免疫病理或保护性免疫的途径，我们应用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了7例因COVID-19住院的患者的外周血单个核细胞（PBMCs），其中4例患有急性呼吸窘迫综合征，六个健康对照组。我们确定了COVID-19外周免疫细胞表型的重构，包括异种干扰素刺激的基因特征、HLAⅡ类下调和中性粒细胞群的发育，这些与急性呼吸衰竭需要机械通气的患者出现的血浆蛋白表达密切相关。重要的是，我们发现外周血单核细胞和淋巴细胞不表达大量的促炎细胞因子。总的来说，我们提供了一个关于严重COVID-19的外周免疫反应的细胞图谱。

9

英文题目：ZipSeq:barcodingforreal-timemappingofsinglecelltranscriptomes

中文题目：ZipSeq：用于单细胞转录体实时定位的条形码

发表时间：-07-06

发表杂志：NatureMethods

影响因子：30.

DOI:10./s---2

摘要：空间转录组学致力于将单细胞转录组学数据整合到多细胞生物学的三维空间中。目前将细胞的位置与其在活组织中的转录组相关联的方法有各种局限性。我们开发了一种称为“ZipSeq”的方法，它使用图案照明和光老化寡核苷酸，在完整组织中的活细胞上实时地连续打印条形码（“zipcodes”），并对图案进行动态选择。利用ZipSeq，我们绘制了三种环境下的基因表达：体外伤口愈合、活淋巴结切片和活肿瘤微环境。在所有病例中，我们发现了与组织结构相关的新基因表达模式。在肿瘤微环境中，这显示了骨髓和T细胞从外周向内分化的轨迹。ZipSeq的组合变异可以有效地缩放定义区域的数量，为实时成像或扰动之后的活体组织的完整绘图提供了途径。

10

英文题目：Self-ReportingTransposonsEnableSimultaneousReadoutofGeneExpressionandTranscriptionFactorBindinginSingleCells

中文题目：自我报告转座子能够同时读出单细胞中的基因表达和转录因子结合

发表时间：-07-18

发表杂志：Cell

影响因子：38.

DOI：10./j.cell..06.

摘要：细胞异质性混淆了转录因子(TF)结合的原位检测。单细胞RNA测序(scRNA-seq)将细胞类型从基因表达中去卷积，但没有技术将细胞身份与这些细胞类型中的TF结合位点(TFBS)联系起来。我们提出了自我报告转座子(SRTs),并将其用于单细胞呼叫卡(scCC)，这是一种在单细胞中同时测量基因表达和定位TFBS的新方法。从mRNA中恢复SRT的基因组位置，通过外源TF-转座酶融合沉积的SRTs用于定位TFBS。然后，我们提出了scCC，它映射来自scRNA-seq文库的SRT，同时识别这些相同细胞中的细胞类型和TFBS。我们使用此技术对多个TF进行基准测试。接下来，我们使用scCC在K细胞中发现BRD4介导的细胞状态转换。最后，我们在单细胞分辨率下定位了小鼠皮层中的BRD4结合位点，建立了一种原位研究TF生物学的新方法。

11

英文题目：Comparativeanalysisofcelllineagedifferentiationduringhepatogenesisinhumansandmiceatthesingle-celltranscriptomelevel

中文题目：在单细胞转录组水平上比较分析人类和小鼠肝发生期间的细胞谱系分化

发表时间：-07-20

发表杂志：Cellresearch

影响因子：20.

DOI：10./s--8-6

摘要：在胚胎发生过程中，肝脏是肝发生和造血的部位，包含许多来自内胚层和中胚层的细胞谱系。然而，这些细胞谱系的特征和发育程序目前仍不清楚，特别是在人类中。在这里，我们对整个发育过程中的人类和小鼠胚胎肝脏进行了单细胞RNA测序。在这里，我们对整个发育过程中的人类和小鼠胚胎肝脏进行了单细胞RNA测序。我们鉴定了内胚层源性、红细胞源性、非红细胞源性造血细胞和中胚层源性非造血细胞4个细胞谱系，并确定了主要细胞谱系的发育途径。在人类和小鼠中，我们鉴定了新的肝系标记和一个ID3+亚群的肝细胞，并验证了成肝细胞遵循“default-directed”模型进行分化。此外，我们发现人而非小鼠的胚胎肝细胞表现出异质性与代谢相关基因的表达相关。我们描述了人类和小鼠造血过程中红祖细胞的发育过程。此外，尽管物种之间的细胞分化程序一般保持不变，但我们在人和小鼠胚胎肝脏的造血过程中观察到不同的细胞谱系组成。总之，这些结果揭示了胎儿肝脏发育的动态细胞图谱，阐明了不同物种肝脏发育的相似性和差异性，为体外诱导各种肝脏细胞系提供了广泛的资源。

12英文题目：Single-cellanalysisofclonalmaintenanceoftranscriptionalandepigeneticstatesincancercells中文题目：单细胞分析癌细胞克隆转录和表观遗传状态维持的机制发表时间：-7发表杂志：NatureGenetics影响因子：27.DOI：10./s---y

摘要：克隆调控程序的传播促进了癌症的发展，但人们对表观遗传机制如何与遗传驱动因子相互作用以重塑这一过程了解甚少。在本研究中，我们通过单细胞转录和DNA甲基化分析与Luria-Delbrück实验设计相结合的方法，证明多种类型的癌细胞中存在克隆稳定的表观遗传记忆。结肠癌克隆细胞群的纵向转录和遗传分析揭示了上皮到间充质转录特征的缓慢漂移谱，这似乎与遗传变异无关。DNA甲基化图谱与这些特征相关，但也反映了独特的节律样甲基化丢失过程。在大多数情况下，甲基化改变可以通过整体反式作用因子的作用来解释。然而，对于特定类型的启动子，特别是癌症-睾丸抗原，去阻抑与顺式甲基化的丧失有关，并可能由其驱动。本研究表明通过表观遗传记忆可以使癌细胞中的基因亚克隆结构多样化。

13

英文题目：MultimodalAnalysisofCompositionandSpatialArchitectureinHumanSquamousCellCarcinoma

中文题目：人鳞状细胞癌组织成分和空间结构的多模态分析

发表时间：-07-23

发表杂志：Cell

影响因子：38.

DOI：10./j.cell..05.

摘要：为了确定皮肤鳞状细胞癌(CSCC)的细胞组成和结构，我们将单细胞RNA测序与空间转录和多路离子束成像相结合，从一系列人CSCC和匹配的正常皮肤中进行了研究。cSCC表现为4个肿瘤亚群，3个重现正常表皮状态，以及肿瘤特有的肿瘤特异性角质形成细胞（TSK）群体，局限于纤维血管微环境。整合单细胞和空间数据将配体-受体网络映射到特定的细胞类型，揭示了TSK细胞是细胞间通讯的枢纽。观察到多种潜在的免疫抑制特征，包括T调节细胞（Treg）与CD8细胞在肿瘤间质中的共定位。最后，人类肿瘤异种移植的单细胞特性和体内CRISPR筛选确定了特定肿瘤亚群丰富的基因网络在肿瘤发生中的重要作用。这些数据定义了cSCC肿瘤和间质细胞亚群，它们相互作用的空间小生境，以及它们参与癌症的通讯基因网络。

14

英文题目：EmergenceofaHigh-PlasticityCellStateduringLungCancerEvolution

中文题目：肺癌演化过程中高可塑性细胞状态的出现

发表时间：-07-23

发表杂志：CancerCell

影响因子：26.

DOI：10./j.ccell..06.

摘要：肿瘤从一个单一的细胞演变成恶性、异质性的组织的过程至今仍知之甚少。在这里，我们描述了基因工程小鼠肺肿瘤从癌前增生到腺癌的七个阶段的单细胞转录体。转录状态的多样性随着时间的推移而增加，并且可以在肿瘤和小鼠之间复制。癌细胞逐渐采用交替的谱系特征，计算预测是通过一种常见的过渡的高可塑性细胞状态（HPCS）介导的。因此，从小鼠肿瘤和人源性异种移植物中分离的HPCS细胞显示出高分化和增殖能力。HPCS过程与人类癌症的低生存率相关，并在小鼠体内显示出化疗耐药性。我们的研究揭示了一个支持肿瘤内异质性的中心原则，并促进了HPCS的治疗靶向性。

15

英文题目：Lineagetracingmeetssingle-cellomics:opportunitiesandchallenges

中文题目：谱系追踪与单细胞组学：机遇与挑战

发表时间：-07-21

发表杂志：NatureReviewsGenetics

影响因子：33.

DOI：10./s---2

摘要：发育干细胞生物学的一个基本目标是绘制分化细胞类型的发育过程(个体发育)图。高通量单细胞测序技术的最新进展使构建成人组织的全面转录图谱和通过测量多达数百万个单个细胞来发育胚胎成为可能。基于测序的谱系追踪方法的平行进展现在促进了克隆关系在这些景观上的映射，并使分子和有丝分裂历史之间的详细比较成为可能。在这里，我们回顾了最近的进展和挑战，以及当这两种互补的细胞历史表示被合成到细胞分化的综合模型中时出现的机会。

16

英文题目：EpigenomicStateTransitionsCharacterizeTumorProgressioninMouseLungAdenocarcinoma

中文题目：表观基因组状态转变表征小鼠肺腺癌的肿瘤进展

发表时间：-07-07

发表杂志：CancerCell

影响因子：26.

DOI：10./j.ccell..06.

摘要：维持功能性、分化细胞状态的调控网络在肿瘤发展过程中往往是不受调控的。在这里，我们使用单细胞表观基因组学来描述肺腺癌(LUAD)小鼠模型中染色质状态的转变。我们确定了一个表观基因组连续体，代表细胞特性的丧失和向转移状态的进展。我们定义了共同可达的调节程序，并推断出这些细胞状态的关键的激活和抑制染色质调节因子。在这些共可及性计划中，我们确定了一个转移前过渡，其特征是激活RUNX转录因子，它介导细胞外基质重塑以促进转移，并预测人类LUAD患者的存活率。综上所述，这些结果证明了单细胞表观基因组学在识别调节程序以揭示肿瘤进展的机制和关键生物标记物方面的力量。

17

英文题目：SinglecellanalysesandmachinelearningdefinehematopoieticprogenitorandHSC-likecellsderivedfromhumanPSCs

中文题目：单细胞分析和机器学习定义了源自人PSCs的造血祖细胞和HSC样细胞

发表时间：-7-2

发表杂志：Blood

影响因子：17.

DOI:10./blood.229

摘要：造血干细胞和祖细胞（hspc）在胚胎发育过程中，在不同的解剖部位通过不同的路径来发育。人多能干细胞（hPSCs）的体外分化能够重现其中的一些过程，然而，已经证明很难产生功能性造血干细胞（HSCs）。为了明确hPSCs体外产生HSPCs的动态性和异质性，我们利用单细胞RNA测序（scRNAseq）和单细胞蛋白表达分析相结合的方法。生物信息学分析和功能验证确定了原始祖细胞、红系祖细胞、巨核细胞和白细胞系祖细胞的转录组，我们分别鉴定了CD44、CD、ICAM2/CD9和CD18作为这些祖细胞的标记物。利用人工神经网络（ANN），我们训练了一个来自人胎肝的scRNAseq，我们能够识别出一系列hPSCs衍生的HPSC表型，包括一个被归类为HSCs的小群体。这种短暂的类HSC的群体随着分化的进行而减少，并且在使用基于cd43表达的细胞生成的数据集中完全缺失。通过比较体外培养的HSC样细胞和胎肝内HSC样细胞的单细胞转录组，我们确定了将来可以开发的转录因子和分子途径来提高HSCs外生产能力。

18

英文题目：Single-celltranscriptomeprofilingrevealsneutrophilheterogeneityinhomeostasisandinfection

中文题目：单细胞转录组分析显示在稳态和感染中中性粒细胞的异质性

发表时间：-7-27

发表杂志：NatureImmunology

影响因子：20.

DOI:10./s---z

摘要：完全的中性粒细胞异质性和分化图谱仍然没有完全的特征。在这里，我们使用单细胞RNA测序对分化和成熟的小鼠中性粒细胞进行了分析，以提供中性粒细胞在稳定状态和细菌感染期间成熟、功能和命运决定的全面转录图。8个中性粒细胞群体通过不同的分子标记被定义。三种成熟的外周血中性粒细胞亚群起源于不同的成熟骨髓中性粒细胞亚群。在已知和未知转录因子的驱动下，中性粒细胞在穿越转录图谱时逐渐获得杀微生物能力，这代表了一种进化的机制，对有效而平衡的中性粒细胞反应进行了精细调节。细菌感染重组了中性粒细胞群体的遗传结构，改变了亚群体之间的动态过渡，并在不影响整体异质性的情况下促进了中性粒细胞的功能增强。总之，这些数据为研究中性粒细胞相关疾病的机制、生物标志物和单细胞分辨率的治疗靶点建立了参考模型和总体框架。

19

英文题目：Investigatinghigher-orderinteractionsinsingle-celldatawithscHOT

中文题目：利用scHOT研究单细胞数据中的高阶交互作用

发表时间：-07-13

发表杂志：Naturemethods

影响因子：30.

DOI：10./s---x

摘要：单细胞基因组学使我们有能力去检测细胞的命运选择。通过计算顺序的“拟时分析”检测细胞，有可能在关键基因之间的变异和共变异中找出细微变化。我们描述了scHOT单细胞高阶测试这种方法，它为识别基因间高阶相互作用中的变化提供了一个灵活且统计稳健的框架。scHOT可以应用于沿连续轨迹或跨越空间的细胞，并适应各种更高阶的测量，包括可变性或相关性。我们通过研究小鼠肝脏胚胎发育过程中高阶相互作用的协调变化来演示scHOT的使用。此外，scHOT利用来自小鼠嗅球的空间分辨转录组数据，确定了跨空间基因之间相关性的细微变化。scHOT对一阶差异表达测试进行了有意义的补充，并提供了一个使用单细胞数据来联系高阶相互作用的框架。

20

英文题目：Toolsfortheanalysisofhigh-dimensionalsingle-cellRNAsequencingdata

中文题目：高维单细胞RNA测序的数据分析工具

发表时间：-07

发表杂志：Naturereviews.Nephrology

影响因子：20.

DOI：10./s--2-0

摘要：在单细胞水平上分析转录组的高通量技术的发展有助于生物学家了解细胞群体、疾病状态和发育谱系的异质性。然而，这些单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术产生了大量的数据，这给分析和解释带来了挑战。此外，scRNA-seq数据集通常包含技术噪声源，这是由于RNA捕获不完全、PCR扩增偏差或患者、样本特有的批次效应。如果不加以处理，这种技术噪音可能会使数据的分析和解释产生偏差。为了应对这些挑战，已经开发了一套计算工具来处理、分析和可视化scRNA-seq数据集。尽管任何给定的scRNA-seq分析的具体步骤可能会因所研究的生物学问题而有所不同，但大多数分析都有核心的工作流程。通常，原始测序数据会加工成基因表达矩阵，然后作归一化和标准化以消除技术噪音。接下来，根据基因表达相似性对细胞进行分组，这些相似性可以归纳为二维或三维，以便在散点图上进行可视化。然后，这些数据可以进一步分析，以提供有关样本中细胞类型或发育轨迹的深入研究。

21

英文题目：Cumulusprovidescloud-baseddataanalysisforlarge-scalesingle-cellandsingle-nucleusRNA-seq

中文题目：“积云”为大规模单细胞和单细胞核RNA测序提供了基于云的数据分析

发表时间：-07-27

发表杂志：Naturemethods

影响因子：30.

DOI：10./s---x

摘要：大规模平行的单细胞和单核RNA测序（sc/snRNA-seq）为健康和疾病的系统组织图谱开辟了道路，但随着数据生成规模的增长，对用于大规模分析的计算流程的需求也随之增加。研究者开发了一个基于云的框架--积云(Cumulus)，用于分析大规模sc/snRNA序列数据集。积云将云计算的强大功能与算法实现的改进相结合，以实现高可伸缩性、低成本、用户友好性和对一整套功能的集成支持。我们在人类细胞图谱的骨髓细胞免疫细胞普查数据集上对积云进行了基准测试，并表明它大大提高了传统框架的效率，同时保持或提高结果质量，使大规模研究成为可能。

22

英文题目：PotentNeutralizingAntibodiesagainstSARS-CoV-2IdentifiedbyHigh-ThroughputSingle-CellSequencingofConvalescentPatientsBCells

中文题目：恢复期患者B细胞高通量单细胞测序鉴定抗SARS-CoV-2的中和抗体

发表时间：-07-09

发表杂志：Cell

影响因子：38.

DOI：10./j.cell..05.

摘要：新冠肺炎COVID-19大流行迫切需要治疗和预防干预。在这里，我们报道了通过高通量单细胞RNA和VDJ测序快速鉴定60名恢复期患者的抗原富集的B细胞的SARS-CoV-2中和抗体。从8,个抗原结合IgG1+的克隆型中鉴定出14个有效的中和抗体，其中最强的一个是BD--2，对假型和正品SARS-CoV-2的IC50值分别为1.2和15ng/mL。BD--2对感染SARS-CoV-2的hACE2转基因小鼠也有较强的治疗和预防作用。此外，中和抗体与尖峰-胞外结构域三聚体复合物的3.8?cryo-EM结构显示抗体的表位与ACE2结合位点重叠。而且，我们还证明了根据预测的CDR3H结构与SARS-CoV-2中和抗体的CDR3H结构的相似性，可以直接选择SARS-CoV-2中和抗体。综上所述，我们表明，通过高通量单B细胞测序可以有效地发现人类中和抗体，以应对大流行传染病。

23

英文题目：AHumanSkeletalMuscleAtlasIdentifiestheTrajectoriesofStemandProgenitorCellsacrossDevelopmentandfromHumanPluripotentStemCells

中文题目：人类骨骼肌图谱确定了干细胞和祖细胞在发育过程中和人类多能干细胞之间的轨迹

发表时间：-07-02

发表杂志：CellStemCell

影响因子：20.86

DOI：10./j.stem..04.

摘要：人类骨骼肌发生的发展轨迹以及祖细胞和干细胞状态之间的转换尚不清楚。我们使用单细胞RNA测序来描述胚胎、胎儿和出生后阶段的人类骨骼肌组织。经由电脑模拟，我们鉴定了肌源性细胞和其他细胞类型，并构建了人类骨骼肌个体发育的“路线图”。以类似的方式，我们还描述了由多个人类多能干细胞(HPSC)肌源性分化方案产生的异质细胞培养，并将hPSC来源的肌源性祖细胞映射到胚胎到胎儿的过渡期。我们发现了不同的丰富的生物学过程，并发现共同调控的基因网络和转录因子存在于不同的肌发生阶段。这项工作为我们提高对人类肌肉发生的认识提供了资源。它还为更好地理解hPSC来源的肌源性祖细胞在骨骼肌再生医学中的转化医学应用提供了一个工具。

24

英文题目：SignallinginputfromdivergentpathwayssubvertsBcelltransformation

中文题目：相异分支的信号输入会破坏B细胞的转化

发表时间：-7-22

发表杂志：Nature

影响因子：42.

DOI:10./s---4

摘要：细胞的恶性转化通常包括几个基因病变，它们的联合活动会导致癌症。在这里，我们分析了1,例病源性B细胞白血病(B-ALL)的样本，发现了单个突变不会促进白血病发生，除非它们汇聚在一个单一的致癌途径上，这是转化B细胞分化阶段的特征。与该中心致癌驱动程序不一致的突变会激活相异分支并破坏转化。致癌病变在B-ALL中常常模拟细胞因子受体在前b细胞阶段(通过激活信号转导蛋白STAT5)或更成熟细胞的前b细胞受体(通过激活蛋白激酶ERK)发出的信号。STAT5-和ERK-激活病变经常多见，但同时发生的占3%左右(P=2.2×10-16)。单细胞突变和磷酸化蛋白分析显示竞争克隆的致癌STAT5和ERK激活分离。STAT5和ERK分别参与由转录因子MYC和BCL6编排的相反的生化和转录程序。发散(抑制)途径的基因重新激活以牺牲主要致癌驱动因素为代价，并逆转转化。相反，不同途径成分的缺失会加速白血病的发生。因此，不同信号分支的持续存在代表了转化的强大障碍，而集中在一个主要驱动因素上定义了白血病启动的中心事件。抑制的发散回路的药理再激活与主要致癌驱动因素的抑制有很强的协同作用。因此，相异分支的重新激活可以作为一种以前未被认识到的策略来增强治疗效果反应。

25

英文题目：Single-celllineageanalysisrevealsgeneticandepigeneticinterplayinglioblastomadrugresistance

中文题目：单细胞谱系分析揭示基因组和表观组在胶质母细胞瘤耐药中的相互作用

发表时间：-7-15

发表杂志：GenomeBiology

影响因子：10.

DOI:10./s59--85-1

摘要：

背景：肿瘤可以通过获得短暂或稳定的基因组和表观组改变来进化和适应治疗压力。要准确理解这些事件如何促进肿瘤内的异质性、动态亚群和总体的肿瘤适合性，将需要实验方法在单细胞水平上前瞻性地标记、追踪和表征耐药或适应性群体。在胶质母细胞瘤中，受体酪氨酸激酶(RTK)治疗效果差的原因有两种，一种是遗传异质性，另一种是避开信号阻断的表观遗传转变。

成果：我们结合细胞谱系条形码和单细胞转录组，追踪RTK抑制剂处理的干样胶质母细胞瘤细胞中出现的耐药性。各种各样的条形码家系采用依赖于Notch的持久表型来维持通过早期药物暴露，而罕见的亚克隆获得的基因变化使它们能够随着时间的推移快速生长。单细胞分析表明，这些遗传亚克隆获得了胰岛素受体底物-1和底物-2(IRS1或IRS2)位点的拷贝数扩增，这两个位点激活了胰岛素和AKT信号程序。在原发性胶质母细胞瘤中，IRS2和其他位点的持久细胞和基因组扩增很明显，这可能是这种疾病靶向治疗无效的原因。

结论：一种结合谱系追踪和scRNA-seq的方法揭示了在异质性胶质母细胞瘤肿瘤模型中互补遗传和表观遗传耐药机制之间的相互作用。

关键词：表观遗传学；遗传学；胶质瘤干细胞；胰岛素受体底物/IRS；谱系追踪；单细胞RNA序列；治疗耐药性；肿瘤异质性。

26

英文题目：Cellatlasofthefoetalhumanheartandimplicationsforautoimmune-mediatedcongenitalheartblock

中文题目：胎儿心脏细胞图谱及自身免疫介导的先天性心脏传导阻滞

发表时间：-07-01

发表杂志：CardiovascularResearch

影响因子：8.

DOI：10./cvr/cvz

摘要：

目的：如果没有正常功能所需细胞类型的分子特征，研究人类心脏发育并将其应用于导致疾病的偏差是不完整的。我们研究了来自妊娠中期健康和抗SSA/Ro相关先天性心脏传导阻滞（CHB）的胎儿人心脏单细胞转录组。

方法和结果：使用Langendorff制剂对三个健康胎儿心脏（妊娠19周至22周）和一个受自身免疫相关CHB影响的胎儿心脏（妊娠21周）进行酶分离，获得单细胞悬浮液，然后进行10×基因组学和Illumina单细胞RNA测序（scRNA-seq）除了心肌细胞、成纤维细胞、免疫细胞和其他小细胞类型外，在人类心脏中还发现了以前未被特征化的内皮细胞亚群。差异基因表达分析显示，和健康对照组相比，CHB心脏不同类型细胞的干扰素反应增加且不均匀。此外，我们还鉴定了在CHB基质细胞中富集的基质体转录物，这些转录物可能导致细胞外基质沉积和随后的纤维化。

结论：这些数据为我们进一步了解人类心脏发育提供了丰富的信息资源，与暴露于母体自身免疫环境的心脏相比，这些数据可用于深入了解疾病的发病机制。

27

英文题目：MemorySequencingRevealsHeritableSingle-CellGeneExpressionProgramsAssociatedwithDistinctCellularBehaviors

中文题目：记忆测序揭示了与不同细胞行为相关的可遗传单细胞基因表达程序

发表时间：-07-26

发表杂志：Cell

影响因子：38.

DOI：10./j.cell..07.

摘要：非遗传因素可以导致单个细胞的基因表达水平随时间而大幅波动。目前尚不清楚这些波动是否能持续比一个细胞分裂的时间长得多。目前测量单细胞基因表达的方法大多依赖于单时间点的测量，使得基因表达波动的持续时间或细胞记忆难以测量。在这里，我们结合Luria和Delbrück’s的波动分析和基于群体的RNA测序（MemorySeq）来识别转录组范围内的基因，这些基因的波动持续了几个阶段。MemorySeq揭示了在其他同质克隆群体中罕见细胞中共同表达的多个基因模块。这些罕见的细胞亚群与生物学上不同的行为有关，比如在抗癌治疗中的增殖。对非遗传、多代波动的识别可以揭示单细胞生物记忆的新形式，并表明细胞状态的非遗传遗传力可能是一种数量特性。

28

英文题目：Single-celllineageanalysisrevealsgeneticandepigeneticinterplayinglioblastomadrugresistance

中文题目：单细胞系分析揭示胶质母细胞瘤耐药的基因组和表观组相互作用

发表时间：-7-15

发表杂志：GenomeBiology

影响因子：10.

DOI：10./s59--85-1

摘要：

背景：肿瘤可以通过获得短暂或稳定的基因组和表观组改变来进化和适应治疗压力。要准确了解这些事件如何促进肿瘤内异质性、动态亚群和整体肿瘤适应度，需要实验方法在单细胞水平上前瞻性地标记、跟踪和描述耐药或其他适应性人群。在胶质母细胞瘤中，受体酪氨酸激酶（RTK）疗法的疗效不佳被认为是遗传异质性或绕过信号传导阻滞的表观遗传转变。

结果：我们结合细胞系条形码和单细胞转录组学来追踪RTK抑制剂治疗的干细胞样胶质母细胞瘤的耐药情况。尽管广泛的条形码谱系采用缺口依赖的持久性表型，通过早期药物暴露维持它们，但很少的亚克隆获得基因改变，使它们能够随着时间的推移迅速增长。单细胞分析显示，这些遗传亚克隆获得胰岛素受体底物1和底物2（IRS1或IRS2）基因座的拷贝数扩增，这些位点激活胰岛素和AKT信号程序。在原发性胶质母细胞瘤中，持续性细胞和IRS2及其他基因座的基因组扩增是明显的，这可能是该病靶向治疗无效的基础。

结论：一种结合谱系追踪和scRNA-seq的方法揭示了异质性胶质母细胞瘤肿瘤模型中互补遗传和表观遗传耐药机制之间的相互作用。

关键词：表观遗传学；胶质瘤干细胞；胰岛素受体底物/IRS；谱系追踪；单细胞RNA序列；抗药性；肿瘤异质性。

IF大于9分的重点文章

序号

杂志

IF

英文题目

中文题目

1

Lancet

60.

Predictingerenumabadverseeventswithsingle-cellgenomics

应用单细胞基因组学预测erenumab的不良反应

2

NatRevCancer

53.03

Thedormantcancercelllifecycle

处于休眠状态的癌细胞生命周期

3

Nature

42.

Asingle-celltranscriptomicatlascharacterizesageingtissuesinthemouse

单细胞转录图谱描述了小鼠衰老组织的特征。

4

Nature

42.

Ageinghallmarksexhibitorgan-specifictemporalsignatures

衰老特征显示器官特异性的时间标志物

5

Nature

42.

Distinctsubnetworksofthethalamicreticularnucleus

丘脑网状核的不同亚网络

6

Nature

42.

Epigeneticregulatorfunctionthroughmousegastrulation

小鼠原肠胚形成的表观遗传调节功能

7

Nature

42.

Mechanismsofstretch-mediatedskinexpansionatsingle-cellresolution

单细胞分辨率下拉伸介导的皮肤扩张机制

8

Nature

42.

Pervasivelesionsegregationshapescancergenomeevolution

普遍的病变分离塑造癌症基因组进化

9

Nature

42.

SignallinginputfromdivergentpathwayssubvertsBcelltransformation

不同信号通路的输入破坏了B细胞转化

10

Nature

42.

Single-celllineagetracingunveilsaroleforTCF15inhaematopoiesis

单细胞谱系追踪揭示了TCF15在造血中的作用

11

Nature

42.

Thechangingmouseembryotranscriptomeatwholetissueandsingle-cellresolution

小鼠胚胎转录组在全组织和单细胞分辨率上的变化

12

Science

41.

Aprogrammablefatedecisionlandscapeunderliessingle-cellaginginyeast

酵母中单细胞老化的可编程命运决定图谱

13

Science

41.

Cancercellsdeploylipocalin-2tocollectlimitingironinleptomeningealmetastasis

癌细胞利用lipocalin-2在软脑膜转移中收集限制性铁

14

Science

41.

HumanCNSbarrier-formingorganoidswithcerebrospinalfluidproduction

人中枢神经系统屏障形成类器官与脑脊液生成

15

Science

41.

Humanfetalmicrogliaacquirehomeostaticimmune-sensingpropertiesearlyindevelopment

人胎儿小胶质细胞在发育早期获得稳态免疫感应特性

16

Cell

38.

MemorySequencingRevealsHeritableSingle-CellGeneExpressionProgramsAssociatedwithDistinctCellularBehaviors

记忆测序揭示与不同细胞行为相关的可遗传单细胞基因表达程序

17

Cell

38.

MicrogliaRequireCD4TCellstoCompletetheFetal-to-AdultTransition

小胶质细胞需要CD4T细胞来完成胎儿到成人的转变

18

Cell

38.

MultimodalAnalysisofCompositionandSpatialArchitectureinHumanSquamousCellCarcinoma

人鳞状细胞癌成分和空间结构的多模态分析

19

Cell

38.

PathogenicMechanismsofSomaticMutationandGenomeMosaicisminAging

衰老过程中体细胞突变和基因组嵌合体的致病机制

20

Cell

38.

PotentNeutralizingAntibodiesagainstSARS-CoV-2IdentifiedbyHigh-ThroughputSingle-CellSequencingofConvalescentPatientsBCells

通过对恢复期患者B细胞的高通量单细胞测序鉴定抗SARS-CoV-2的强中和抗体

21

Cell

38.

Self-ReportingTransposonsEnableSimultaneousReadoutofGeneExpressionandTranscriptionFactorBindinginSingleCells

自我报告转座子能够同时读出单细胞中的基因表达和转录因子结合

22

NatBiotechnol

36.

Celltypeprioritizationinsingle-celldata

细胞类型在单细胞数据中的优化

23

NatMed

36.13

Asingle-cellatlasoftheperipheralimmuneresponseinpatientswithsevereCOVID-19

重症新冠肺炎患者COVID-19外周免疫反应的单细胞图谱

24

NatRevGenet

33.

Lineagetracingmeetssingle-cellomics:opportunitiesandchallenges

谱系追踪与单细胞组学：机遇与挑战

25

NatMethods

30.

Cumulusprovidescloud-baseddataanalysisforlarge-scalesingle-cellandsingle-nucleusRNA-seq

Cumulus为大规模单细胞和单核RNA-seq提供基于云的数据分析

26

NatMethods

30.

Improvingsingle-cellRNAcounting

单细胞RNA计数方法的改进

27

NatMethods

30.

Investigatinghigher-orderinteractionsinsingle-celldatawithscHOT

使用scHOT研究单细胞数据中的更高指令交流

28

NatMethods

30.

ZipSeq:barcodingforreal-timemappingofsinglecelltranscriptomes

ZipSeq：用于单细胞转录组实时映射的barcoding

29

CancerDiscov

29.

TumorMicroenvironmentIsCriticalfortheMaintenanceofCellularStatesFoundinPrimaryGlioblastomas

肿瘤微环境对于原发性胶质母细胞瘤中细胞状态的维持至关重要

30

CancerDiscov

29.

UtilityofHuman-DerivedModelsforGlioblastoma

人源性胶质母细胞瘤模型的应用

31

NatGenet

27.

ImpreciseDNMT1activitycoupledwithneighbor-guidedcorrectionenablesrobustyetflexibleepigeneticinheritance

不精确的DNMT1活性与邻居引导的校正相结合，可以实现稳健而灵活的表观遗传基因组

32

NatGenet

27.

Single-cellanalysisofclonalmaintenanceoftranscriptionalandepigeneticstatesincancercells

癌细胞表观组和基因组状态克隆维持的单细胞分析

33

CancerCell

26.

CytotoxicCD4(+)TCellsinBladderCancer-ANewLicensetoKill

膀胱癌中的细胞毒性CD4(+)T细胞--一种新的杀灭许可证

34

CancerCell

26.

EmergenceofaHigh-PlasticityCellStateduringLungCancerEvolution

肺癌演变过程中高可塑性细胞状态的发生

35

CancerCell

26.

EpigenomicStateTransitionsCharacterizeTumorProgressioninMouseLungAdenocarcinoma

表观基因组状态转变表征小鼠肺腺癌的肿瘤进展

36

CancerCell

26.

MYCDrivesTemporalEvolutionofSmallCellLungCancerSubtypesbyReprogrammingNeuroendocrineFate

MYC通过重新编程神经内分泌推动小细胞肺癌亚型的时间演示

37

CancerCell

26.

Single-CellAnalysesintheMulti-omicsEra

多组学时代的单细胞分析

38

CancerCell

26.

Single-CellRNA-SeqRevealsCellularHierarchiesandImpairedDevelopmentalTrajectoriesinPediatricEpendymoma

单细胞RNA测序揭示小儿室管膜瘤的细胞层次结构和受损的发育轨迹

39

CancerCell

26.

Sub-group,Sub-type,andCell-typeHeterogeneityofEpendymoma

室管膜瘤的亚群、亚型、细胞型的异质性

40

Circulation

23.

PathogenicAutoimmunityinAtherosclerosisEvolvesfromInitiallyProtectiveApoB-ReactiveCD4(+)T-RegulatoryCells

动脉粥样硬化中的致病性自身免疫从最初的保护性ApoB响应CD4（+）T调节细胞演变而来

41

Circulation

23.

Single-CellRNASequencingtoDissecttheImmunologicalNetworkofAutoimmuneMyocarditis

单细胞RNA测序分析自身免疫性心肌炎的免疫网络

42

Circulation

23.

TheStemCellPluripotencyGenesKlf4andOct4RegulateComplexSMCPhenotypicChangesCriticalinLate-StageAtheroscleroticLesionPathogenesis

干细胞多能性基因Klf4和Oct4调节复杂的平滑肌细胞表型变化，在动脉粥样硬化的晚期病变中起关键作用

43

Immunity

22.

AnIntegratedMulti-omicSingle-CellAtlasofHumanBCellIdentity

人类B细胞多组分单细胞图谱的建立

44

Immunity

22.

ComplexAutoinflammatorySyndromeUnveilsFundamentalPrinciplesofJAK1KinaseTranscriptionalandBiochemicalFunction

复杂的自体炎症综合征揭示了JAK1激酶转录和生化功能的基本原理

45

Immunity

22.

DifferentialIRF8TranscriptionFactorRequirementDefinesTwoPathwaysofDendriticCellDevelopmentinHumans

不同的IRF8转录因子需求决定了人类树突状细胞发育的两条途径

46

CellStemCell

20.86

AHumanSkeletalMuscleAtlasIdentifiestheTrajectoriesofStemandProgenitorCellsacrossDevelopmentandfromHumanPluripotentStemCells

人类骨骼肌图谱确定了干细胞和祖细胞在整个发育过程中的轨迹，以及来自人类多能干细胞的轨迹

47

CellStemCell

20.86

Cell-by-CellDeconstructionofStemCellNiches

干细胞龛的逐细胞解构

48

CellStemCell

20.86

InflammatorySignalsInduceAT2Cell-DerivedDamage-AssociatedTransientProgenitorsthatMediateAlveolarRegeneration

炎症信号诱导AT2细胞源性损伤相关的短暂性祖细胞介导肺泡再生

49

AccChemRes

20.

MagneticRankingCytometry:ProfilingRareCellsattheSingle-CellLevel

磁排序细胞术：在单细胞水平上分析稀有细胞

50

NatRevNephrol

20.

Toolsfortheanalysisofhigh-dimensionalsingle-cellRNAsequencingdata

高维单细胞RNA测序数据分析工具

51

JHepatol

20.

IntegrativemolecularprofilingofautoreactiveCD4Tcellsinautoimmunehepatitis

自身免疫性肝炎自身反应性CD4T细胞的综合分子分析

52

CellRes

20.

Comparativeanalysisofcelllineagedifferentiationduringhepatogenesisinhumansandmiceatthesingle-celltranscriptomelevel

人和小鼠肝发生过程中细胞谱系分化的单细胞转录组水平比较分析

53

CellRes

20.

Single-celltranscriptomicsrevealsregulatorsunderlyingimmunecelldiversityandimmunesubtypesassociatedwithprognosisinnasopharyngealcarcinoma

单细胞转录组学揭示了与鼻咽癌预后相关的免疫细胞多样性和免疫亚型的潜在调控因子

54

CellRes

20.

Transdifferentiationoftumorinfiltratinginnatelymphoidcellsduringprogressionofcolorectalcancer

大肠癌进展过程中肿瘤浸润的固有淋巴样细胞的转分化

55

NatImmunol

20.

NovelHexb-basedtoolsforstudyingmicrogliaintheCNS

用于研究中枢神经系统小胶质细胞的基于Hexb的新工具

56

NatImmunol

20.

Single-celltranscriptomeprofilingrevealsneutrophilheterogeneityinhomeostasisandinfection

单细胞转录组谱分析揭示中性粒细胞在稳态和感染中的异质性

57

NatImmunol

20.

Theactivationtrajectoryofplasmacytoiddendriticcellsinvivoduringaviralinfection

病毒感染期间体内浆细胞样树突状细胞的激活轨迹

58

NatCellBiol

20.

DissectingintratumourheterogeneityofnodalB-celllymphomasatthetranscriptional,geneticanddrug-responselevels

淋巴结B细胞淋巴瘤在转录、遗传和药物反应水平上的肿瘤内异质性分析

59

NatCellBiol

20.

Persistenceofaregeneration-associated,transitionalalveolarepithelialcellstateinpulmonaryfibrosis

肺纤维化中再生相关的移行性肺泡上皮细胞状态的持续性

60

Gut

19.

Genomicandtranscriptomicprofilingofcarcinogenesisinpatientswithfamilialadenomatouspolyposis

家族性腺瘤性息肉病患者致癌作用的基因组和转录组分析

61

NatPhys

19.

Theroleofsinglecellmechanicalbehaviorandpolarityindrivingcollectivecellmigration

单细胞机械行为和极性在驱动集体细胞迁移中的作用

62

NatBiomedEng

18.

Trackingtheexpressionoftherapeuticproteintargetsinrarecellsbyantibody-mediatednanoparticlelabellingandmagneticsorting

通过抗体介导的纳米颗粒标记和磁性分选跟踪治疗性蛋白靶点在稀有细胞中的表达

63

Blood

17.

SinglecellanalysesandmachinelearningdefinehematopoieticprogenitorandHSC-likecellsderivedfromhumanPSCs

单细胞分析和机器学习定义了源自人类PSC的造血祖细胞和HSC样细胞

64

Blood

17.

Single-cellgenomicsrevealsthegeneticandmolecularbasesforescapefrommutationalepistasisinmyeloidneoplasms

单细胞基因组学揭示了髓系肿瘤逃避突变上位性的遗传和分子基础

65

AmJRespirCritCareMed

17.

ASingle-cellAtlasoftheHumanHealthyAirways

人体健康气道单细胞图谱

66

AmJRespirCritCareMed

17.

ChemokineReceptor2-targetedMolecularImaginginPulmonaryFibrosis

肺纤维化中趋化因子受体2靶向分子成像

67

AmJRespirCritCareMed

17.

ExpressionoftheSARS-CoV-2ACE2ReceptorintheHumanAirwayEpithelium

SARS-CoV-2ACE2受体在人体气道上皮中的表达

68

AmJRespirCritCareMed

17.

SingleCellReconstructionofHumanBasalCellDiversityinNormalandIPFLung

正常人和IPF肺基底细胞多样性的单细胞重建

69

AmJRespirCritCareMed

17.

Single-cellRNAExpressionProfilingofACE2,TheReceptorofSARS-CoV-2

SARS-CoV-2受体ACE2的单细胞RNA表达谱分析

70

AmJRespirCritCareMed

17.

SpelunkinginSputum:SingleCellRNASequencingShedsNewInsightsintoCysticFibrosis

痰的探索：单细胞RNA测序为囊性纤维化提供了新见识

71

Gastroenterology

17.

CombinationofPD-1InhibitorandOX40AgonistInducesTumorRejectionandImmuneMemoryinMouseModelsofPancreaticCancer

PD-1抑制剂与OX40激动剂联合诱导胰腺癌小鼠模型的肿瘤排斥反应和免疫记忆

72

Gastroenterology

17.

IncreasedProductionofLIGHTbyTCellsinEosinophilicEsophagitisPromotesDifferentiationofEsophagealFibroblastsTowardanInflammatoryPhenotype

嗜酸性食管炎中T细胞产生的LIGHT增多，促进了食管成纤维细胞向炎性表型的分化。

73

AnnRheumDis

16.

Quantitativeplanararrayscreenofproteinsuncoversnovelurinaryproteinbiomarkersoflupusnephritis

种蛋白质的定量平面阵列筛选揭示了狼疮性肾炎的新型尿蛋白生物标志物

74

JAmChemSoc

14.

CounteranionsintheStimulationSolutionAltertheDynamicsofExocytosisConsistentwiththeHofmeisterSeries

刺激液中的反阴离子改变了符合Hofmeister级数的胞吐作用动力学

75

JAmChemSoc

14.

DNA-BasedNanostructuresforLive-CellAnalysis

用于活细胞分析的基于DNA的纳米结构

76

ACSNano

14.

HybridElectro-PlasmonicNeuralStimulationwithVisible-Light-SensitiveGoldNanoparticles

可见光敏感金纳米粒子复合电等离子体神经刺激

77

CircRes

14.

ImpactofLocalAllo-ImmunityandRecipientCellsinTransplantArteriosclerosis

局部同种免疫和受体细胞在移植性动脉硬化中的影响

78

CircRes

14.

Meta-AnalysisofLeukocyteDiversityinAtheroscleroticMouseAortas

动脉粥样硬化小鼠主动脉中白细胞多样性的Meta分析

79

CircRes

14.

RegulatoryTCellsLicenseMacrophagePro-ResolvingFunctionsDuringAtherosclerosisRegression

动脉粥样硬化消退过程中调节性T细胞许可巨噬细胞的促分解功能

80

Neuron

14.

Cell-TypeSpecificityofGenomicImprintinginCerebralCortex

大脑皮层基因组印迹的细胞类型特异性

81

Neuron

14.

ExtractionofDistinctNeuronalCellTypesfromwithinaGeneticallyContinuousPopulation

从遗传连续的族群中提取不同神经元类型

82

TrendsMicrobiol

13.

ChallengesofStudyingtheHumanVirome-RelevantEmergingTechnologies

人类病毒相关新兴技术研究的挑战

83

SignalTransductTargetTher

13.

SinglecelltranscriptomerevealedSARS-CoV-2entrygenesenrichedincolontissuesandassociatedwithcoronavirusinfectionandcytokineproduction

单细胞转录组研究揭示SARS-CoV-2病毒参与结肠组织的基因富集以及冠状病毒感染与细胞因子产生的关联性

84

SciImmunol

13.44

ImmunophenotypingofCOVID-19andinfluenzahighlightstheroleoftypeIinterferonsindevelopmentofsevereCOVID-19

重症COVID-19研究进展中Ⅰ型干扰素在COVID-19和流行感冒的免疫分型中扮演着突出的作用

85

TrendsImmunol

13.

UnderstandingNormalandMalignantHumanHematopoiesisUsingNext-GenerationHumanizedMice

利用下一代人源化小鼠了解正常和恶性人类造血

86

JAMACardiol

12.

AssociationofClonalHematopoiesisofIndeterminatePotentialWithInflammatoryGeneExpressioninPatientsWithSevereDegenerativeAorticValveStenosisorChronicPostischemicHeartFailure

严重退行性主动脉瓣狭窄患者不确定潜在的克隆造血和炎症基因表达的研究

87

AnnuRevNeurosci

12.

3DBrainOrganoids:StudyingBrainDevelopmentandDiseaseOutsidetheEmbryo

3D脑器官:研究胚胎外的大脑发育和疾病

88

NatEcolEvol

12.

Adaptationtolowparasiteabundanceaffectsimmuneinvestmentandimmunopathologicalresponsesofcavefish

对低寄生虫丰度的适应影响腔鱼的免疫投入和免疫病理反应

89

JCachexiaSarcopeniaMuscle

12.

Age-relateddeclineofinterferon-gammaresponsesinmacrophageimpairssatellitecellproliferationandregeneration

巨噬细胞中年龄相关的干扰素-伽马反应的下降会损害卫星细胞的增殖和再生

90

JCachexiaSarcopeniaMuscle

12.

Single-celldeconstructionofpost-sepsisskeletalmuscleandadiposetissuemicroenvironments

脓毒症后骨骼肌和脂肪组织微环境的单细胞解构

91

MolPsychiatry

12.

LossoffunctionofthemitochondrialpeptidasePITRM1inducesproteotoxicstressandAlzheimersdisease-likepathologyinhumancerebralorganoids

线粒体肽酶PITRM1功能丧失诱导蛋白毒性应激和类阿尔茨海默病样病理改变

92

NatCommun

12.

Amolecularmapofmurinelymphnodebloodvascularendotheliumatsinglecellresolution

小鼠淋巴结血管内皮细胞单细胞分辨分子图

93

NatCommun

12.

Acceleratedsinglecellseedinginrelapsedmultiplemyeloma

加速单细胞接种治疗复发性多发性骨髓瘤

94

NatCommun

12.

AlveolarregenerationthroughaKrt8+transitionalstemcellstatethatpersistsinhumanlungfibrosis

持续存在于人肺纤维化的Krt8+过渡干细胞状态下的肺泡再生

95

NatCommun

12.

AnOTX2-PAX3signalingaxisregulatesGroup3medulloblastomacellfate

OTX2-PAX3信号轴调控第3组髓母细胞瘤细胞命运

96

NatCommun

12.

Emergingheterogeneous